Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP46P62068 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP46P62068 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP46P62068 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP46P62068 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP46P62068 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP46P62068 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP46P62068 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP46P62068 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP46P62068 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP46P62068 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP46P62068 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP46P62068 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms