Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VBP1P61758 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VBP1P61758 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VBP1P61758 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms