Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN15P56746 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms