Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA3P52797 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms