Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RORCP51449 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RORCP51449 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RORCP51449 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms