Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CRIP1P50238 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms