Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A3P48764 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A3P48764 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A3P48764 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A3P48764 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A3P48764 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A3P48764 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A3P48764 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A3P48764 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A3P48764 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A3P48764 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A3P48764 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A3P48764 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms