Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTDSS1P48651 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms