Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD4P46934 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms