Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK1P39086 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK1P39086 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms