Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FLT4P35916 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FLT4P35916 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FLT4P35916 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLT4P35916 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLT4P35916 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLT4P35916 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLT4P35916 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLT4P35916 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLT4P35916 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLT4P35916 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FLT4P35916 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms