Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms