Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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CASQ1P31415 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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CASQ1P31415 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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CASQ1P31415 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASQ1P31415 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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