Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms