Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms