Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB2P26583 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms