Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PTPRBP23467 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PTPRBP23467 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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