Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYF6P23409 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYF6P23409 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYF6P23409 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms