Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBTFP17480 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBTFP17480 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBTFP17480 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBTFP17480 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBTFP17480 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBTFP17480 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBTFP17480 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms