Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA2P17301 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms