Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A1P11836 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms