Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBP07199 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBP07199 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBP07199 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms