Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTA1P02549 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms