Protein–RNA interactions for Protein: O75871

CEACAM4, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM4O75871 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM4O75871 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms