Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NBNO60934 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NBNO60934 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NBNO60934 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NBNO60934 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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