Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PRAMEF10O60809 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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PRAMEF10O60809 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PRAMEF10O60809 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF10O60809 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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