Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAK2O60296 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms