Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DENRO43583 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DENRO43583 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DENRO43583 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DENRO43583 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DENRO43583 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DENRO43583 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DENRO43583 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DENRO43583 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DENRO43583 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms