Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9YO00507 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9YO00507 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP9YO00507 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP9YO00507 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP9YO00507 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9YO00507 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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