Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01387J3KSC0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01387J3KSC0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms