Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms