Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4E171 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4E171 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
B4E171 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B4E171 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4E171 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
B4E171 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4E171 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4E171 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4E171 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4E171 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4E171 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4E171 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4E171 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4E171 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4E171 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4E171 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
B4E171 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B4E171 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4E171 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4E171 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms