Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms