Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms