Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWA8A3KMH1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms