Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F8A0AVK6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F8A0AVK6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms