Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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ARL2-SNX15V9GYD0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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ARL2-SNX15V9GYD0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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ARL2-SNX15V9GYD0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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