Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNX8Q9Y5X2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNX8Q9Y5X2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms