Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FARSAQ9Y285 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms