Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIPT1Q9Y234 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms