Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSEQ9UL01 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSEQ9UL01 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms