Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM5BQ9UGL1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDM5BQ9UGL1 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms