Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CGGBP1Q9UFW8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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