Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms