Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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