Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC4Q9UBN4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms