Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00474Q9P2X8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms