Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHRF1Q9P1Y6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms