Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4Q9P0V3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms