Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DNAJC28Q9NX36 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms